2000-2003：走向繁荣
到了2000年的时候，HDS的Lightning 9900系列前端和后端已经全面完成从SCSI到光纤的过渡，IBM的Shark系列前端实现了FC、SCSI、SSA以及Ficon多种接口协议的支持，后端采用自己独特的SSA连接协议，但SSA本身是一种高性能磁盘通道协议，因此即使Shark在后端不支持光纤通道，也仍然在高端市场拥有广泛的市场认可度。
只有EMC Symmetrix系列，虽然在前端已经实现了光纤主机接口的支持，但后端仍然沿用了老旧的SCSI协议技术，在中高端市场的竞争中不免处于劣势。
其实，最后一代基于SCSI总线协议的Symmetrix 8000已经支持到了384块磁盘，使用扩展性极为有限的并行SCSI总线协议实现整体系统384快磁盘的支持，实际上是一项庞大而复杂的工程，就总体成本而言，基于SCSI的EMC Symmetrix相比IBM Shark以及HDS Lightning未必就占有优势。但在高端存储系统中沿用过时的技术，仍然使EMC Symmetrix系列受到业界的质疑和诟病。
到了2003年，EMC第一款基于直连矩阵架构的高端光纤存储系统终于问世，后端首次在其高端阵列中采用了FC-AL的连接方式，在业界看来，这一产品的发布对于EMC来说显然有些拖延和滞后，所幸这款产品很快得到了市场的认可。EMC也在产品命名上强调了该产品基于FC的高端品质：DMX系列是Direct Matrix Architecture的简写，代表“直连矩阵架构”，并行SCSI可无法做到。
就像HDS的Hi-star架构一样，DMX架构成为EMC高端产品线的架构基础，几经升级和修改一直延续到今天，直至2009年（今年）EMC发布更新的v-max架构。新发布的v-max架构将与DMX架构一起成为EMC高端产品线的两大产品系列。
尽管姗姗来迟，但EMC总算是彻底完成从SCSI到FC的过渡，此时光纤通道已经成为中高端磁盘阵列不二之选，FC的两种架构，一个称霸前端，一个雄踞后端，牢牢把持网络存储领域的核心地位。光纤通道正式迎来了在网络存储领域的辉煌鼎盛时代。
在这一阶段值得一提的事件还包括，EMC收购Data General公司后，于2002年正式推出第一代中端产品线，CLARiiON CX200、CX400和CX600，此后，CLARiiON系列也几经升级换代，推出了包括CX300/500/700、CX3、以及最新CX4多个系列的产品，但基本架构仍然沿用了最早Data General公司的产品雏形。
HDS也在2002年对第一代Hi-Star进行了改进，在原有Hi-Star结构基础上提高核心运算能力，增加内部通道数量和带宽，升级前后端控制器上的CPU，推出了基于Hi-Star II结构的9900V高端存储系统，该系统的性能、扩展性、可靠性等全面超过9900，成为HDS公司又一个成功的高端存储系统，在当时的存储市场极具影响力，是极为经典的一代高端存储系统。
