由于是一个端口对应多个终端设备，因此必须具有一个机制来决定数据通路：什么时候使用哪一个设备？什么时候进行传输？这些都是需要考虑的问题。
Port Multiplier具有两种切换机制：Command-based Switching和FIS-based Switching，可以翻译为基于命令的切换机制和基于FIS的切换机制，FIS（Frame Information Structure，帧信息结构）是SATA为了实现异步传输数据块而使用的封包，“正常”的SATA设备都使用FIS，除了第一代推出的实际上是包装过的PATA（同步传输）。要支持FIS，也需要驱动的支持，标准的AHCI规范使用了FIS。
Command-based Switching基于命令的切换机制：控制器端口在同一时间只对一个设备发起命令，这种方式就是简单地对端口进行扩展
和PATA相比，SATA的FIS结构允许异步ATA传输，例如，SATA控制器发出读取命令之后可以去干其它事情，驱动器（如，SATA硬盘）准备好数据之后，再主动发送数据给SATA控制器（当然，要具有FIS），控制器并不知道驱动器读取数据需要的时间，在PATA上，只能使用一个块一个块地传输-确认-传输-确认循环，SATA FIS就不需要这样。
FIS-based Switching基于FIS的切换机制：除了发起命令，控制器端口还可以执行来自任何设备的命令，这些都是可以同时进行的，因此提供了最大的性能
显然，对于通常的点对点SATA而言，FIS虽然有用，不过并不明显，在Port Multiplier端口复用器的情况下，FIS可以发挥到最大的效用。FIS-based Switching基于FIS的切换机制允许主控制器不停地发出命令，终端设备则不停工作，并可以在任意的时候发送数据给控制端（当然，Port Multiplier需要进行拥挤管理），这样的结构可以实现最大的并行处理并达到最高的效率。
